如何用 Python 将 .SVS 文件轻松转换为 .JPEG 文件？

2024-03-17 11:21:30

如何使用 Python 将 .SVS 文件转换为 .JPEG

引言

在医学图像处理中，.SVS（Slide Virtual Scanning）文件是显微镜扫描仪生成的高分辨率数字图像的常见格式。虽然 .SVS 文件提供了出色的图像保真度，但它们体积庞大，与他人共享或在线查看时会遇到困难。因此，将 .SVS 文件转换为更易于管理的格式（例如 .JPEG）就变得十分必要。本教程将指导你如何使用 Python 中的 tifffile 库实现此转换。

步骤

1. 安装 tifffile 库

pip install tifffile

2. 导入必需的库

import tifffile
import numpy as np
from PIL import Image

3. 加载 .SVS 文件

使用 tifffile 库中的 imread() 函数加载 .SVS 文件。

svs_image = tifffile.imread("path/to/input.svs")

4. 将 .SVS 转换为 NumPy 数组

imread() 函数返回一个三维 NumPy 数组，其中每个维度分别表示图像的宽度、高度和颜色通道。

5. 转换 NumPy 数组为 .JPEG 图像

要将 NumPy 数组转换为 .JPEG 图像，请使用 PIL 库中的 fromarray() 和 save() 函数。

jpeg_image = Image.fromarray(svs_image)
jpeg_image.save("path/to/output.jpg", quality=100)

6. 优化 JPEG 图像质量

save() 函数允许你通过 quality 参数指定 JPEG 图像的质量。值介于 0 到 100 之间，其中 100 表示最高质量。

7. 保存 JPEG 图像

保存转换后的 JPEG 图像。

示例代码

import tifffile
import numpy as np
from PIL import Image

svs_path = "path/to/input.svs"
jpeg_path = "path/to/output.jpg"

# 加载 .SVS 文件
svs_image = tifffile.imread(svs_path)

# 将 .SVS 转换为 NumPy 数组
numpy_image = np.array(svs_image)

# 转换 NumPy 数组为 .JPEG 图像
jpeg_image = Image.fromarray(numpy_image)

# 优化 JPEG 图像质量
jpeg_image.save(jpeg_path, quality=100)

print("转换完成！")