跟着Nature Plants学作图：ggplot2绘制分组折线图和置信区间

2023-10-23 07:58:21

分组折线图与置信区间：提升您的 R 语言数据可视化技巧

准备踏上一段精彩的制图之旅吧！在 Nature Plants 的引领下，我们将深入探索 R 语言中的分组折线图和置信区间。掌握这些强大的可视化工具，让您的数据脱颖而出，清晰展示您的发现。

绘制分组折线图：揭示趋势

分组折线图是展示不同类别或条件随时间或其他变量变化趋势的有力工具。它们通过将数据点按组连接起来，帮助您识别模式、差异和联系。

使用 ggplot2 绘制分组折线图非常简单。只需执行以下步骤：

ggplot(data, aes(x = x_variable, y = y_variable, group = group_variable)) +
  geom_line()

data：包含您要绘制的数据的 DataFrame。
aes(x = x_variable, y = y_variable, group = group_variable)：定义图的坐标轴和分组变量。
geom_line()：添加折线图几何图形。

加入置信区间：增强可信度

置信区间为您的数据增加了一层可信度。它们显示了数据点的变化幅度，让您更准确地传达您的发现。在 ggplot2 中添加置信区间非常简单：

ggplot(data, aes(x = x_variable, y = y_variable, group = group_variable)) +
  geom_line() +
  geom_ribbon(aes(ymin = ymin, ymax = ymax), fill = "gray80")

geom_ribbon(aes(ymin = ymin, ymax = ymax), fill = "gray80")：添加一个带填充的置信区间几何图形。

案例研究：揭示蕨类演化的奥秘

为了进一步理解，让我们使用 Nature Plants 中提供的蕨类演化数据集来绘制分组折线图和置信区间。

library(ggplot2)
library(dplyr)

# 加载蕨类演化数据集
fern_data <- read.csv("fern_evolution.csv")

# 创建分组折线图
ggplot(fern_data, aes(x = generation, y = size, group = species)) +
  geom_line() +
  geom_ribbon(aes(ymin = ymin, ymax = ymax), fill = "gray80") +
  labs(title = "Fern Size Over Generations",
       x = "Generation",
       y = "Size")