返回

MIMIC-III数据库:从申请到应用,轻松上手!

后端

MIMIC-III数据库:医学研究中的宝库

在医学研究领域,MIMIC-III数据库无疑是一个宝贵的资源。这个庞大的数据库包含了超过40000名住院病人的电子病历数据,为研究人员提供了丰富的宝贵资料。如果你是一个医学研究人员,那么熟练掌握MIMIC-III数据库的使用方法将为你打开一扇研究新大门。

如何申请和下载MIMIC-III数据库?

申请

  1. 访问PhysioNet网站(https://physionet.org/
  2. 点击“Databases”标签
  3. 在数据库列表中找到“MIMIC-III Clinical Database”
  4. 点击“Apply for Access”
  5. 填写申请表,提供你的个人信息和机构信息
  6. 选择你想要访问的数据集

下载

一旦你的申请获得批准,你将收到一封包含下载链接的电子邮件。点击链接并下载数据压缩包。请注意,数据压缩包非常大,可能需要一段时间才能下载完成。

如何将MIMIC-III数据库导入PostgreSQL?

解压数据压缩包

下载数据压缩包后,使用7-Zip或WinRAR等解压缩软件解压数据。解压后的数据将是一个名为“mimiciii”的文件夹。

导入数据

使用pgAdmin4导入数据:

  1. 创建一个新的PostgreSQL数据库
  2. 右键单击该数据库,选择“Import”选项
  3. 选择“Copy Data from Another Server”选项
  4. 在“Server”字段中输入localhost
  5. 在“Port”字段中输入5432
  6. 在“Database”字段中输入你刚创建的数据库名称
  7. 在“Username”字段中输入postgres
  8. 在“Password”字段中输入postgres的密码
  9. 点击“Next”按钮
  10. 在“Tables”字段中选择你要导入的数据表
  11. 点击“Next”按钮
  12. 在“Options”字段中选择“Create table”选项
  13. 点击“Next”按钮
  14. 在“Summary”字段中查看导入数据的详细信息,然后点击“Finish”按钮

如何通过pgAdmin4查看、管理和导出MIMIC-III数据库?

数据导入PostgreSQL后,你可以通过pgAdmin4查看、管理和导出数据。你可以使用pgAdmin4:

  • 查看数据表
  • 创建视图
  • 执行查询
  • 导出数据到CSV、JSON或XML等格式

常见的MIMIC-III数据库常见问题解答

Q:谁可以申请使用MIMIC-III数据库?

A:任何在进行医学研究的个人或机构都可以申请使用MIMIC-III数据库。

Q:数据更新的频率是多少?

A:MIMIC-III数据库每半年更新一次。

Q:如何引用MIMIC-III数据库?

A:在你的研究论文中引用MIMIC-III数据库时,请使用以下引用格式:
Johnson, A. E., Pollard, T. J., Shen, L., Lehman, L. W., Feng, M., Ghassemi, M., Moody, B., Szolovits, P., Celi, L. A., & Mark, R. G. (2016). MIMIC-III, a freely accessible critical care database. Scientific Data, 3(1), 160035. https://doi.org/10.1038/sdata.2016.35

Q:是否有其他类似MIMIC-III数据库的资源?

A:是的,还有其他类似MIMIC-III数据库的资源,包括eICU Collaborative Research Database (eICU-CRD)和Multiparameter Intelligent Monitoring in Intensive Care (MIMIC) IV。

Q:在哪里可以获得有关MIMIC-III数据库的更多信息?

A:有关MIMIC-III数据库的更多信息,请访问PhysioNet网站(https://physionet.org/)。