基因变异寻路:从「BFS」到「A*」
2023-09-04 14:59:39
在生物学领域,基因序列尤为重要,它们记录着生物体遗传信息的蓝图。基因变异则是生物进化和适应环境的驱动力。而找出在最小基因变化下,从起始序列变异到目标序列的寻路过程,就成为了一项极具挑战性的计算难题。
本次探索之旅将带领我们深入 LeetCode 433 号问题:「最小基因变化」。我们将以独到的视角,从广度优先搜索(BFS)、双向 BFS、启发式 A* 算法,乃至图论构建和深度优先搜索(DFS)等多重维度,逐一剖析问题的解题思路。
从「BFS」到「双向 BFS」
「BFS」可谓探索未知领域的利器,它一步步扩展搜索范围,直至找到目标。在最小基因变化问题中,我们可以将基因序列之间的变异关系构建成一张图。起始序列为起点,目标序列为终点,基因变异操作则构成图中的边。
利用「BFS」,我们可以从起点出发,层层扩展,逐一探索基因变异的可能性。当扩展到目标序列时,我们便可得到一条从起始序列到目标序列的基因变异路径。
然而,「BFS」也存在一个弊端:当图中的边数过多时,搜索范围会呈指数级增长,导致效率低下。为了优化搜索过程,我们可以引入「双向 BFS」策略。
「双向 BFS」同时从起点和终点出发,双向扩展搜索范围。当两波搜索相遇时,便找到了最短的基因变异路径。这种双向夹击的策略大幅缩小了搜索范围,显著提升了效率。
启发式 A* 算法:寻路的「捷径」
面对规模庞大的图,即使「双向 BFS」也难免力不从心。此时,启发式 A* 算法便粉墨登场了。
A* 算法是一种启发式搜索算法,它在「BFS」的基础上融入了启发式函数。启发式函数根据搜索状态评估距离终点的远近,从而引导搜索过程朝着更有希望的方向前进。
在最小基因变化问题中,我们可以采用如下启发式函数:
f(n) = g(n) + h(n)
其中:
- f(n) 为从起点到当前状态 n 的总评估值
- g(n) 为从起点到当前状态 n 的实际路径长度
- h(n) 为从当前状态 n 到目标状态的启发式估计距离
建图 + DFS:另一种解题思路
除了「BFS」和 A* 算法之外,最小基因变化问题还可以通过构建图 + DFS 的方式解决。
具体而言,我们将基因变异关系构建成一张图,然后利用 DFS(深度优先搜索)遍历这张图。当 DFS 遇到目标序列时,便找到了最短的基因变异路径。
与「BFS」类似,DFS 也存在搜索范围过大的问题。因此,在实践中,通常会采用「记忆化搜索」的优化策略,避免重复探索相同的状态。
结语
最小基因变化问题的解决过程,充分展现了算法设计的多样性和灵活性。从「BFS」的层层推进,到「双向 BFS」的双管齐下,再到 A* 算法的启发式寻路,乃至建图 + DFS 的另辟蹊径,每一种方法都体现了算法的独特魅力。
纵览全局,本文以别具一格的视角,将不同解题思路串联起来,不仅为理解最小基因变化问题提供了多维度的剖析,也为算法学习者拓宽了思路,启迪了创新。